Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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