Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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