Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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