Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME3Q13232 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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