Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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NR1H3Q13133 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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NR1H3Q13133 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms