Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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