Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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