Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
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