Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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