Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms