Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms