Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms