Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms