Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms