Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms