Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OC90Q02509 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OC90Q02509 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms