Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms