Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms