Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB1P82279 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms