Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFI35P80217 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFI35P80217 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFI35P80217 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFI35P80217 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFI35P80217 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFI35P80217 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFI35P80217 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFI35P80217 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFI35P80217 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI35P80217 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI35P80217 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI35P80217 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms