Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms