Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms