Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms