Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RPL23P62829 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RPL23P62829 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RPL23P62829 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms