Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms