Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB25P57735 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB25P57735 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB25P57735 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB25P57735 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms