Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSCP56915 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSCP56915 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSCP56915 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSCP56915 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms