Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CLDN15P56746 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CLDN15P56746 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN15P56746 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN15P56746 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN15P56746 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN15P56746 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN15P56746 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN15P56746 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN15P56746 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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