Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH11P55287 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH11P55287 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH11P55287 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH11P55287 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH11P55287 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH11P55287 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH11P55287 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH11P55287 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH11P55287 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH11P55287 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH11P55287 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH11P55287 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH11P55287 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH11P55287 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms