Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms