Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms