Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms