Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZA1P52907 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms