Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SMARCA2P51531 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SMARCA2P51531 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMARCA2P51531 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SMARCA2P51531 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMARCA2P51531 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMARCA2P51531 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SMARCA2P51531 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMARCA2P51531 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMARCA2P51531 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMARCA2P51531 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMARCA2P51531 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMARCA2P51531 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms