Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms