Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBP2P50120 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBP2P50120 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBP2P50120 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBP2P50120 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBP2P50120 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBP2P50120 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBP2P50120 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBP2P50120 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP2P50120 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms