Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRE11P49959 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRE11P49959 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRE11P49959 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRE11P49959 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRE11P49959 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRE11P49959 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MRE11P49959 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRE11P49959 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRE11P49959 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRE11P49959 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRE11P49959 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRE11P49959 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRE11P49959 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRE11P49959 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRE11P49959 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRE11P49959 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRE11P49959 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRE11P49959 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms