Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT3P49368 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT3P49368 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCT3P49368 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms