Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK8P49336 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK8P49336 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK8P49336 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms