Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms