Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NESP48681 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NESP48681 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NESP48681 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NESP48681 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NESP48681 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NESP48681 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NESP48681 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NESP48681 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NESP48681 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NESP48681 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NESP48681 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NESP48681 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NESP48681 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NESP48681 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NESP48681 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms