Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms