Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNJ1P48048 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNJ1P48048 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms