Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms