Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDIT3P35638 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms