Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COPB2P35606 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPB2P35606 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPB2P35606 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPB2P35606 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms