Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA4P35212 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA4P35212 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA4P35212 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA4P35212 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA4P35212 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA4P35212 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA4P35212 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA4P35212 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA4P35212 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA4P35212 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA4P35212 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA4P35212 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms