Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms