Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms