Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms